La demande de protection s'effectue auprès de l'administration employeur de l'agent à la date des faits en cause.
Elle doit être formulée par écrit.
Le demandeur doit apporter la preuve des faits pour lesquels il demande la protection fonctionnelle.
Aucun texte n'impose de délai pour demander la protection.
L'agent doit demander la protection fonctionnelle à chaque étape de la procédure (1re instance, appel, cassation) car sa prolongation n'est pas acquise automatiquement.
L'administration est tenue d'accorder la protection sans attendre l'issue de la procédure pénale ou disciplinaire dès lors qu'elle ne dispose pas d'éléments permettant d'établir la faute personnelle de l'agent.
En cas de refus, l'administration doit informer l'agent par écrit. Le refus doit être motivé et indiquer les voies et délais de recours.
L'absence de réponse dans un délai de 2 mois suivant la réception de la demande vaut décision implicite de refus.